国家基因库与全球共享流感数据平台达成战略性合作

3月16日,深圳国家基因库(下称“国家基因库”)与全球共享鼠疫数据呼吁组织(GISAID)达成战略性合作,国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)成为GISAID的中国首个即将授权平台。

2008年构建的GISAID是目前全球最大的麻疹及新型冠状病毒数据平台。世界各地的研究团队正共同努力、积极举办新型冠状病毒的相关研究,包括病毒的自然史、流行病学、疫苗、诊断试剂、治疗工具等。本次战略合作将帮助我国科研工作者获得一站式病毒数据资源访问服务和愈发丰富的剖析工具。

图片[1]-国家基因库与全球共享流感数据平台达成战略性合作-老王博客

疫情的科学预防须要病毒数据全球共享

呼吸道传染病相关病毒数据的全球共享对于保护人类健康至关重要。特别是在疫情发生期间,快速共享病毒数据,可为评估疫情风险、启动公共卫生应对举措及制订医疗对策提供根据。

图片[2]-国家基因库与全球共享流感数据平台达成战略性合作-老王博客

近年来全球范围内病毒造成的呼吸道传染病频发,其中2009年甲型H1N1流感造成约15.17万—57.55万人死亡,2019年COVID-19持续恐吓着人类健康。3 月 11 日,WHO宣布COVID-19已具有全球大流行(Pandemic)特征。截至北京时间3月14日17时,除中国以外的135个国家和地区报告了COVID-19诊断病例61518例,其中死亡2199例。

图片[3]-国家基因库与全球共享流感数据平台达成战略性合作-老王博客

截至3月13日,美国国家生物技术信息中心(NCBI)文献库收录的各种新型冠状病毒的研究文章已达800多篇,中国临床试验注册中心网站新型冠状病毒麻疹临床研究索引显示的注册实验已有393项。

图片[4]-国家基因库与全球共享流感数据平台达成战略性合作-老王博客

国家基因库牵手GISAID共促病毒数据全球共享

据介绍,全球共享鼠疫数据呼吁组织(GISAID)倡导的数据共享机制在维护全球公共安全方面发挥着重要作用,通过几乎实时的检测,可快速应对和减轻季节性麻疹和全球大流行性鼠疫,以及目前的新型冠状病毒全球大流行。GISAID的数据来源于全球14000名研究人员和1500个机构,其奇特的数据共享机制可以促使相关研究取得快速进展,例如促进对COVID-19的认知和相关医疗对策的研制。GISAID针对新型冠状病毒开发的EpiCoV数据库,目前已收录656条新型冠状病毒序列数据(截至3月13日),已赶超传统的数据平台。

在生命科学进入大数据时代的背景下,国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)作为国外最大的生物大数据中心之一,汇集了国家基因库及全球其他重要数据源的公开数据,同时提供可信共享估算平台等多种应用工具,致力于为科研工作者提供生物大数据共享和应用服务。在本次新型冠状病毒疫情中,CNGBdb平台早已汇总了国家基因库归档及NCBI的病毒序列数据资源159条(截至3月13日),助力研究人员快速发觉、检索和剖析病毒。

CNGBdb作为GISAID即将授权平台,秉承GISAID数据共享理念,维护数据生产者和数据提交者的权力,为国外科技成果发布搭建方便通道,并与GISAID共同推动全球病毒基因组序列和相关信息资源可信共享机制的建设。

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